Burdur İlinde Plum pox virus’un Tespiti ve Kısmi Kılıf Protein Geninin Moleküler Karakterizasyonu

Plum pox virus (PPV), sert çekirdekli meyvelerde önemli verim kayıplarına sebep olan Şarka hastalığının etmenidir. PPV, Türkiye’nin farklı bölgelerinde sınırlı olarak tespit edilmesine rağmen, bugüne kadar Burdur iline ait herhangi bir kayıt bulunmamaktadır. Bu çalışmada, 2016-2019 yılları arasında ilinde PPV’nin varlığının belirlenmesine yönelik serolojik ve moleküler yöntemler kullanılarak yapılan araştırmanın sonuçlarına yer verilmiştir. Sürveyler süresince toplanan 47 adet meyve yaprak örneği ilk Double antibody sandwich enzyme linked immunosorbent assay (DAS-ELISA) ile analiz edilmiş 2 şeftali örneğinin PPV enfekteli olduğu belirlenmiştir. Çalışmada, kılıf protein bölgesi için 767 nükleotid büyüklüğünde bölgeyi çoğaltan dejenere primer çifti tasarlanmıştır. Yeni primerler gerçekleştirilen Reverse transcription-polymerase chain reaction (RT-PCR) sekans analizleri sonucunda elde edilen diziler GenBank’a kaydedilmiştir. Yapılan BlastN analizi neticesinde izolatları en yüksek benzerlik oranını (%99.86-%98.49), PPV-M ırkı göstermiştir. Neighbour-joining yöntemiyle filogenetik ağaçta izolatlarının, Türkiye ülkelere izolatı kümelendiği çalışma Akdeniz Bölgesi’nin açısından ari alanı konumunda niteliğindedir. Çalışma ağaçlar eradike edilerek 1 km çapında tampon bölge oluşturulmuş 3 yıl boyunca Prunus türlerinin yetiştiriciliğinin yasaklanmasına sürvey çalışmalarınnın devam karar